衛斯理(劉德華),一個從事跟蹤、調查神秘事件的男人,是聯合國外星生物分析局的特別成員,處理地球上一切和外星生物有關的事件一次,衛斯理在古董店參觀一塊奇異的藍色人骨時,遇到了少時曾有一面之緣的藍血人-- 擁有藍色血液的外星人,「她」的名字叫方天涯(關芝琳),外表就和一般美女無異。衛斯理正想留住方天涯,這時附近卻發生了一宗外星生物突襲事件,美國的外星生物調查機構--隸屬FBI的Double X Unit小組 奉命到場,由隊中精英白素(舒淇)和白奇偉(張耀揚)兄妹領隊。白氏兄妹帶領著X組精銳部隊進入事發大廈,與具有A級戰鬥力的外星生物交戰。衛斯理也前來助陣,無奈,不敵強大的對手,身受重傷,而方天涯亦在此時再次現身,以奇異的力量救了衛斯理,殺死了強大的外星怪物。 原來方天涯乃藍血星人「深藍[又稱藍血星]--獵戶星座中最明亮的星體」,六百年前為保護藍血聖經而離開故鄉,在回程時遇上了流星雨,天涯便乘逃生倉來到地球,更和弟弟失散,而藍色的人骨,正是天涯的弟弟tan所有。 衛斯理受傷昏迷期間,被白氏兄妹所救,而白素在照顧衛斯理之時,竟禁不住對衛暗生情愫,但衛斯理的心中記掛的卻是在腦海中留下深刻記憶的方天涯,衛斯理遂借X組的最高負責人威爾遜之力,動用X組中的特異功能人士,以腦電波找尋方天涯的去向,但威爾遜為了在美國國會中得到絕對的權力,竟利用衛斯理找到方天涯,暗中派人把天涯擄走,並進行了一連串不人道的實驗,衛斯理抗議無效,反被軟禁。白氏兄妹看不過眼欲阻止,卻被威爾遜解除武裝,免去職務 ……. 再此同時,兩名來自藍血星的異類生物Kill(鄭浩南)和Rape(黃佩霞)降落地球,原來本一向和平寧靜的藍血星,被兇殘太空侵略者「獲殼衣毒間」感染,此刻Kill和Rape到來,就是想找到藍血聖經,獲得無窮的力量。Kill和Rape兇殘無比,他們找到了被X組通緝的大騙子郭博士(王晶),郭眼見性命不保,答應帶Kill到X總部找尋方天涯。在小王的領路下,Kill和Rape突然襲擊X總部,將威爾遜和大批X組員殺死,X總部也以自毀爆滅。衛斯理、方天涯和白素逃出。 衛等人回到香港,便和聯合國人員與Double X 交涉,要他們交出Tan,從而得知Tan在日本,天涯獲悉後,十分開心,並馬上聯絡上Tan,知Tan次日會到香港會面,涯聽後情不自禁吻衛,二人終爆發激情,進行了一次外星異物和地球人靈與欲的徹底溝通--神交…… 但被白素見到,素傷心不已。 次日,Tan突然出現與天涯相見。Tan叫天涯與Rape,Kill合作,交出藍血聖經便可回故鄉,天涯拒之,Tan用計搶走藍血聖經和天涯,Tan將天涯帶到廢置工廠見Kill和Rape,Tan打算交易…… 這時,小女孩過腦電波聯絡天涯,告知衛,天涯深愛著他,衛心如刀割。白素趕到,帶來一批武器,決定和衛一同與外星生物決一死戰,營救天涯和藍血聖經.....